PRÁCTICA I: BÚSQUEDA DE INFORMACIÓN CIENTÍFICA


Fecha: 7 Noviembre 2012
Asignatura: Ecotoxicología
5º Licenciatura Biología, Universidad de Alcalá
Profesor: Álvaro Alonso Fernández (Dpto. Ecología)
Lugar: Aula de informática 2 (Edificio de Ciencias) 15:00-17:00h
Duración: 4 horas

Las fuentes de información científica son muy numerosas y en ocasiones su uso puede ser complejo. En la práctica de hoy nuestro objetivo es familiarizarnos con el manejo de una base de datos que nos permita encontrar información relacionada con el área de la Ecotoxicología. Además hablaremos de algunas de las revistas científicas más importantes en el área de la Ecotoxicología.

Grupos de trabajo de 2-3 personas

Hay que responder a todas las preguntas en azul de la práctica. Las respuestas hay que presentarlas en un documento Word (.doc) o PDF con el nombre de los componentes del grupo y al final de la práctica me lo adjuntáis en un e-mail (alvaro.alonso@uah.es), en ASUNTO: práctica 1 Ecotox. El fichero se nombra como: PRACT1-ECOTOX-NOMBRE COMPLETO DE UN COMPONENTE.

IMPORTANTE: graba desde el principio el archivo y cada cierto tiempo lo vuelves a hacer

1. Base de Datos ISI Web of Knowledge


Utilizaremos una de las más empleadas ISI Web of Knowledge.

Practica_1.jpg

La parte superior permite buscar por:

TOPIC: es decir por contenido en todo el texto del artículo
TITLE: busca la palabra o palabras introducidas en el título de la publicación
AUTHOR: autores. Para ello necesitamos el apellido y las iniciales (Ej; Smith J) o solo el apellido
PUBLICATION NAME: La revista en dónde se encuentra el artículo que nos interesa (Ej; Ecotoxicology)
YEAR PUBLISHED: año de publicación del artículo
ADDRESS: dirección de los autores o de alguno de ellos (Ej; Alcalá University) o por el país de alguno de los autores (Ej; Germany)
etc.

Podemos buscar de forma encadenada (and), alternativa (or) o excluyente (not). De esta forma las combinaciones posibles son muy numerosas y podemos ajustar nuestra búsqueda al máximo. Esto se selecciona en las ventanas emergentes que aparecen entre los campos anteriormente explicados. Lo importante es ir de una búsqueda muy genérica e ir reduciendo el número de artículos por medio de diferentes combinaciones de palabras.

Con la opción "Add another field" (en azul a mitad de pantalla) podemos añadir tantos campos como queramos.

La parte inferior de la página nos permite principalmente seleccionar un rango de años de búsqueda y configurar la disposición de la salida de información.

Vamos a practicas con un ejemplo sencillo:

Tenemos esta referencia y queremos ver si se encuentra disponible en nuestra Universidad (si se encuentra suscrita y podemos descargarnos el artículo en pdf):

Ike M, Chen MY, Jin CS, Fujita M (2002) Acute toxicity, mutagenicity, and estrogenicity of biodegradation products of bisphenol A. ENVIRONMENTAL TOXICOLOGY 17: 457-461

Intenta que el la pantalla de resultados te salga un número de referencias inferior a 5 sin tener que escribir todo el título del artículo ¿cómo lo has logrado? (1)

Pincha en la referencia, ¿Qué información te ofrece el buscador sobre la referencia? (2)

¿Puedes leer el artículo completo? De todas las demás referencias que te han quedado ¿hay algún artículo al que puedas acceder en su totalidad? indica cuál/es (3)

Ahora busca al menos 3 referencias que se relacionen con el tema del artículo anterior publicadas entre 2005 y 2007 (4). Tienes que indicar la combinación de palabras que has empleado e incluir dichas referencias en tu fichero utilizando el formato de cita empleado anteriormente. Indica las combinaciones de palabras que has utilizado (campos, and, or, not, etc.)

Continuamos utilizando la base de datos, ahora nos interesa un tema concreto en lugar de buscar un artículo específico. Nuestro tema de búsqueda será "la toxicidad del cadmio en Daphnia magna durante los años 2004 y 2005" (en inglés). Haz una lista con todas las referencias que encuentres sobre el tema y la combinación de palabras empleadas (5).

Para guardar la lista de referencias (si el ordenador tiene la posibilidad se puede imprimir en pdf, en caso contrario como txt):

Practica_1-Grabar_información_del_Web.jpg

Ahora nos interesa saber qué estudios se han realizado sobre contaminación de las aguas del río Henares, ¿cómo lo has hecho? (6) ¿qué referencias has encontrado? (7) ¿hay algún artículo al que puedas acceder? ¿cuáles? (8)

2. Revistas de Ecotoxicología: "Ecotoxicology" y "Ecotoxicology and Environmental Safety"


Hay muchas y muy variadas, entre las más específicas de Ecotoxicología se encuentran:

ECOTOXICOLOGY


Ecotoxicology is an international journal devoted to presenting fundamental research on the effects of toxic chemicals on populations, communities and terrestrial, freshwater and marine ecosystems. It elucidates mechanisms and processes whereby chemicals exert their effects on ecosystems, and examines the impact caused at the population or community level. The journal is not restricted with respect to taxon or biome, presenting papers that indicate possible new approaches to regulation and control of toxic chemicals and that formulate ways of conserving threatened species. The journal includes not only original research papers but technical notes and review articles, both invited and submitted. A strong, broadly based editorial board ensures as wide an international coverage as possible.

Journal-Ecotoxicology.jpg


Busca información sobre Gammarus fossarum empleando el buscador de la revista Ecotoxicology (la búsqueda se limita a los artículos publicados en dicha revista), indica el número de artículos encontrados. Haz lo mismo en el ISI Web of Knowledge con el nombre de la especie ¿Qué problema encuentras a una búsqueda y a la otra?(9)

ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY


Ecotoxicology and Environmental Safety focuses on integrated mechanistic research related to short- and long-term pathways and interactions of substances and chemical mixtures in environmental systems and subsystems on their bioavailability, circulation, and assimilation in target organisms, as well as biological responses of these organisms, and damage mechanisms (endocrine disruption, genotoxicity); and on their subsequent fate in the food chain, including humans. Novel technologies, techniques, and methods such as biomedical photonic technologies, biomarkers, biosensors and bioanalytical systems, QSARs and QSPRs, advanced high-performance computational methods, models, and storage systems, and their applications in obtaining and processing interdisciplinary ecotoxicological information are also addressed in the journal. We welcome the applied outcome of complex ecotoxicological research such as developing the science-based Environmental Quality Criteria (EQC), standard toxicity tests, techniques, and methods for ecotoxicological evaluation of the environment, as well as developing ecotoxicologically proven methods and technologies for prevention, interception, and remediation of human-induced damage to ecosystems. The above scope of the journal is aimed at providing science-based tools for sustainably managing the environment through risk assessment, risk characterization, risk prediction, and risk management.
The journal publishes regular research articles, highlighted research articles and Frontier Articles.

Practica_1-EES.jpg

Repite las preguntas 4 y 5 de la parte anterior (10) empleando el buscador (search) de la revista Ecotoxicology and Environmental Safety (la búsqueda se limita a los artículos publicados en dicha revista)


IMPORTANTE: antes de finalizar la práctica debes enviar el fichero o los ficheros (si generas un pdf con los listados de referencias) a alvaro.alonso@uah.es. El fichero se nombra como: PRACT1-ECOTOX-NOMBRE COMPLETO DE UN COMPONENTE y en el ASUNTO: práctica 1 Ecotox.






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